Biserica Sfântul Nicolae datează ca așezământ din 1292 și a fost construită inițial de către localnici, fiind ulterior sprijinită și de domnitorul Țării Românești, Neagoe Basarab, începând cu anul 1495.

Biserica și școala românească, construite în apropierea ei, au constituit un centru spiritual și cultural pentru românii din Țara Bârsei. În special, activitatea lor a avut un impact semnificativ asupra întregii comunități românești, mai ales după ce diaconul Coresi a început să tipărească aici cărți bisericești în limba română.

Inițial, biserica a fost construită în stil gotic, suferind ulterior diverse transformări și adoptând stilul baroc. În secolul XVIII, planul bisericii a fost extins, adăugându-se paraclise și un pridvor. În perioada interbelică, Biserica Sfântul Nicolae a fost renovată, păstrând încă fresce semnate de marele pictor Costin Petrescu.

Biserica din Șchei a beneficiat de sprijinul numeroșilor domni, fiind înzestrată cu o colecție importantă de icoane vechi donate de voievozii celor două țări românești.